NumPy 的分派机制(在numpy版本v1.16中引入)是编写与numpy API兼容并提供numpy功能的自定义实现的自定义N维数组容器的推荐方法。
应用包括 dask 数组(分布在多个节点上的N维数组)
和 cupy 数组(GPU上的N维数组)。
为了获得编写自定义数组容器的感觉,我们将从一个简单的示例开始,该示例具有相当狭窄的实用程序,但说明了所涉及的概念。
>>> import numpy as np
>>> class DiagonalArray:
... def init(self, N, value):
... self._N = N
... self._i = value
... def repr(self):
... return f"{self.class.name}(N={self._N}, value={self._i})"
... def array(self):
... return self._i * np.eye(self._N)
...
我们的自定义数组可以实例化,如下所示:
>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> arr
DiagonalArray(N=5, value=1)
我们可以使用 numpy.array
或 numpy.asarray
, 转换为numpy数组,这将调用它的 array
方法来获得标准 numpy.ndarray
。
>>> np.asarray(arr)
array([[1., 0., 0., 0., 0.],
[0., 1., 0., 0., 0.],
[0., 0., 1., 0., 0.],
[0., 0., 0., 1., 0.],
[0., 0., 0., 0., 1.]])
如果我们使用 numpy 函数对 arr
进行操作,numpy 将再次使用 array
接口将其转换为数组,然后以通常的方式应用该函数。
>>> np.multiply(arr, 2)
array([[2., 0., 0., 0., 0.],
[0., 2., 0., 0., 0.],
[0., 0., 2., 0., 0.],
[0., 0., 0., 2., 0.],
[0., 0., 0., 0., 2.]])
注意,返回类型是标准 numpy.ndarray
。
>>> type(arr)
numpy.ndarray
我们如何通过此函数传递我们的自定义数组类型?Numpy允许类指示它希望通过交互 array_ufunc
和 array_function
以自定义方式处理计算。
让我们一次拿一个,从 array_ufunc__
开始。
此方法涵盖 Universal functions (ufunc),
这是一类函数,包括例如 numpy.multiply
和 numpy.sin
。
_arrayufunc
获得:
ufunc
, 一个类似numpy.multiply
的函数method
,一个字符串,区分numpy.multiply(...)
。
以及numpy.multiy.outer
、numpy.multiy.accumate
等变体。对于常见情况,numpy.multiply(...)
,method='call'
。inputs
, 可能是不同类型的混合kwargs
, 传递给函数的关键字参数
对于这个例子,我们将只处理方法 'call
。
>>> from numbers import Number
>>> class DiagonalArray:
... def init(self, N, value):
... self._N = N
... self._i = value
... def repr(self):
... return f"{self.class.name}(N={self._N}, value={self._i})"
... def array(self):
... return self._i * np.eye(self._N)
... def array_ufunc(self, ufunc, method, *inputs, **kwargs):
... if method == 'call':
... N = None
... scalars = []
... for input in inputs:
... if isinstance(input, Number):
... scalars.append(input)
... elif isinstance(input, self.class):
... scalars.append(input._i)
... if N is not None:
... if N != self._N:
... raise TypeError("inconsistent sizes")
... else:
... N = self._N
... else:
... return NotImplemented
... return self.class(N, ufunc(*scalars, *kwargs))
... else:
... return NotImplemented
...
现在让我们的自定义数组类型通过numpy的函数。
>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> np.multiply(arr, 3)
DiagonalArray(N=5, value=3)
>>> np.add(arr, 3)
DiagonalArray(N=5, value=4)
>>> np.sin(arr)
DiagonalArray(N=5, value=0.8414709848078965)
此时 arr + 3
不起作用。
>>> arr + 3
TypeError: unsupported operand type(s) for : 'DiagonalArray' and 'int'
为了支持它,我们需要定义Python接口 add
, lt
等,以便调度到相应的ufunc。 我们可以通过继承mixin NDArrayOperatorsMixin
来方便地实现这一点。
>>> import numpy.lib.mixins
>>> class DiagonalArray(numpy.lib.mixins.NDArrayOperatorsMixin):
... def init(self, N, value):
... self._N = N
... self._i = value
... def repr(self):
... return f"{self.class.name}(N={self._N}, value={self._i})"
... def array(self):
... return self._i * np.eye(self._N)
... def array_ufunc(self, ufunc, method, *inputs, **kwargs):
... if method == 'call':
... N = None
... scalars = []
... for input in inputs:
... if isinstance(input, Number):
... scalars.append(input)
... elif isinstance(input, self.class):
... scalars.append(input._i)
... if N is not None:
... if N != self._N:
... raise TypeError("inconsistent sizes")
... else:
... N = self._N
... else:
... return NotImplemented
... return self.class(N, ufunc(*scalars, **kwargs))
... else:
... return NotImplemented
...
>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> arr + 3
DiagonalArray(N=5, value=4)
>>> arr > 0
DiagonalArray(N=5, value=True)
现在让我们来解决 __array_function
。 我们将创建将 numpy 函数映射到我们的自定义变体的 dict。
>>> HANDLED_FUNCTIONS = {}
>>> class DiagonalArray(numpy.lib.mixins.NDArrayOperatorsMixin):
... def init(self, N, value):
... self._N = N
... self._i = value
... def repr(self):
... return f"{self.class.name}(N={self._N}, value={self._i})"
... def array(self):
... return self._i np.eye(self._N)
... def __array_ufunc__(self, ufunc, method, inputs, kwargs):
... if method == 'call':
... N = None
... scalars = []
... for input in inputs:
... # In this case we accept only scalar numbers or DiagonalArrays.
... if isinstance(input, Number):
... scalars.append(input)
... elif isinstance(input, self.class):
... scalars.append(input._i)
... if N is not None:
... if N != self._N:
... raise TypeError("inconsistent sizes")
... else:
... N = self._N
... else:
... return NotImplemented
... return self.class(N, ufunc(*scalars, *kwargs))
... else:
... return NotImplemented
... def array_function__(self, func, types, args, kwargs):
... if func not in HANDLED_FUNCTIONS:
... return NotImplemented
... # Note: this allows subclasses that don't override
... # array_function to handle DiagonalArray objects.
... if not all(issubclass(t, self.class__) for t in types):
... return NotImplemented
... return HANDLED_FUNCTIONS[func](args, kwargs)
...
一个便捷的模式是定义一个可用于向 HANDLED_FUNCTIONS
添加函数的装饰器 实现
。
>>> def implements(np_function):
... "Register an array_function__ implementation for DiagonalArray objects."
... def decorator(func):
... HANDLED_FUNCTIONS[np_function] = func
... return func
... return decorator
...
现在我们为 DiagonalArray
编写numpy函数的实现。
为了完整性,为了支持使用 arr.sum()
,
添加一个调用 numpy.sum(self)
的方法 sum
,对于 mean
来说也是一样的。
>>> @implements(np.sum)
... def sum(a):
... "Implementation of np.sum for DiagonalArray objects"
... return arr._i * arr._N
...
>>> @implements(np.mean)
... def sum(a):
... "Implementation of np.mean for DiagonalArray objects"
... return arr._i / arr._N
...
>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> np.sum(arr)
5
>>> np.mean(arr)
0.2
如果用户尝试使用 HANDLED_FUNCTIONS
中未包含的任何numpy函数,
则numpy将引发 TypeError
,表示不支持此操作。
例如,连接两个 DiagonalArrays
不会产生另一个对角线数组,因此不支持它。
>>> np.concatenate([arr, arr])
TypeError: no implementation found for 'numpy.concatenate' on types that implement array_function: [<class 'main__.DiagonalArray'>]
另外,我们的 sum
和 mean
实现不接受numpy实现的可选参数。
>>> np.sum(arr, axis=0)
TypeError: sum() got an unexpected keyword argument 'axis'
用户总是可以选择使用 numpy.asarray
转换为普通的 numpy.asarray
,并使用标准的numpy。
>>> np.concatenate([np.asarray(arr), np.asarray(arr)])
array([[1., 0., 0., 0., 0.],
[0., 1., 0., 0., 0.],
[0., 0., 1., 0., 0.],
[0., 0., 0., 1., 0.],
[0., 0., 0., 0., 1.],
[1., 0., 0., 0., 0.],
[0., 1., 0., 0., 0.],
[0., 0., 1., 0., 0.],
[0., 0., 0., 1., 0.],
[0., 0., 0., 0., 1.]])
有关自定义数组容器的更完整工作示例,请参阅dask源代码和cupy源代码。
另外可以看一下 NEP 18。